Secuencia de largo terminal repetida

Nombre y opción de cola

El genoma de la levadura Saccharomyces cerevisiae contiene cinco familias retrotranspap: TY1 a TY5. Los LTR de estos 5 elementos son diferentes en tamaño y secuencia y son designados por letras griegas.

nombre y tamaño de la LTR
ty1 Δ334pb
TY2 Δ332PB
ty3 σ340pb
τ371pb
TY5 ω251PB

CompositorModifier

Se subdividen en tres regiones, mencionadas en relación con su posición en el ARNm: U3 (para un único en 3 ‘del ARN), R (para repetidas en ambos extremos del ARN) y U5 ( por solo 5 ‘ARN).

Los estudios realizados en el efecto de las deleciones de fragmentos o sustituciones de base de la secuencia SOLO-LTR HIS4-912Δ mostraron que los LTR que tienen todas las señales necesarias para comenzar y en la terminación de la transcripción por RNA polimerasa II (Fulton et al 1988, Hirschman et al., 1988, Dudley et al., 1999). Las secuencias promotoras (caja TATA) solo están activas a nivel del LTR en 5 ‘porque requieren la presencia de regiones reguladoras de la transcripción, ubicadas aguas abajo al comienzo de la fase de codificación TYA (Fulton et al. 1988). Por otro lado, los sitios de poliadenilación solo están activos a nivel de la LTR en 3 ‘, ya que requieren la presencia de regiones reguladoras presentes solo en la parte 3’ del ARNm Ty (Hou et al., 1994). La región R de la LTR se encuentra en ambos extremos de la transcripción y es esencial para la transcripción opuesta de este ADNNA ARNm.

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