Unha base de datos pública para o novo esquema MLST para Treponema Pallidum subsp. Pallidum: Vixilancia e epidemioloxía do axente causante de sífilis.

Resumo: Treponema Pallidum subsp. Pallidum é o axente causante de sífilis, unha enfermidade de transmisión sexual con prevalencia mundial. Existen actualmente varios esquemas de dixitación molecular diferentes para este patóxeno. Para habilitar estudos de bioloxía de poboación do axente de sífilis e para a vixilancia epidemiolóxica a escala global, hai que introducir unha ferramenta de dixitación harmonizada. Recentemente, publicamos unha nova secuencia de secuencias multi-locus (MLST) co potencial de mellorar significativamente os datos epidemiolóxicos en varios aspectos (por exemplo, distinguindo os clados xeneticamente diferentes de sífilis, subtítulos dentro destes clados e, finalmente, distinguindo diferentes subespecies de non Treponemas patóxenos cultivables). Neste breve informe, presentamos a base de datos Pubmlst para o almacenamento de datos de ADN treponemal e para asignacións de perfís alélicos e tipos de secuenciación. Ademais, resumimos datos epidemiolóxicos de todas as cepas treponemais (n = 358) con secuencias de ADN dispoñibles en escribir loci e atoparon varias asociacións entre grupos xenéticos e características dos pacientes. Este estudo propón o establecemento dun único MLST de T. P. Pallidum e anima aos investigadores e ás comunidades de saúde pública usar esta base de datos Pubmlst como unha ferramenta universal para estudos de dixitación molecular do patóxeno de sífilis.

Deixa unha resposta

O teu enderezo electrónico non se publicará Os campos obrigatorios están marcados con *