Um banco de dados público para o novo esquema MLST para Treponema Pallidum Subsp. Pallidum: vigilância e epidemiologia do agente causador da sífilis.

resumo: Treponema Pallidum subsp. Pallidum é o agente causador da sífilis, uma doença sexualmente transmissível com prevalência mundial. Vários esquemas de digitação moleculares diferentes estão atualmente disponíveis para este patógeno. Para permitir estudos de biologia populacional do agente da sífilis e para vigilância epidemiológica na escala global, uma ferramenta de digitação harmonizada precisa ser introduzida. Recentemente, publicamos uma nova digitação de sequência multi-locus (MLST) com o potencial para melhorar significativamente os dados epidemiológicos em vários aspectos (por exemplo, distinguindo clades geneticamente diferentes de sífilis, subtircendo dentro desses clados e, finalmente, distinguindo diferentes subespécies de Treponemes patogênicos cultiváveis). Neste breve relatório, introduzimos o banco de dados PUBMLST para armazenamento de dados do DNA Treponemal e para atribuições de perfis alélicos e tipos de sequenciamento. Além disso, resumimos dados epidemiológicos de todas as cepas Treponemais (n = 358) com sequências de DNA disponíveis em taxas de digitação e encontramos várias associações entre grupos genéticos e características dos pacientes. Este estudo propõe o estabelecimento de um único mlst de T. p. Pallidum e encoraja pesquisadores e comunidades de saúde pública a usar este banco de dados PUBMLST como uma ferramenta universal para estudos de digitação moleculares do patógeno da sífilis.

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