O bază de date publică pentru noua schemă Mlst pentru Treponema Palidum Subsp. palidum: supravegherea și epidemiologia agentului cauzal al sifilisului.

Rezumat: Treponema palidum subsp. Palidum este agentul cauzal al sifilisului, o boală cu transmitere sexuală cu prevalență la nivel mondial. Mai multe scheme de tipare moleculară diferite sunt disponibile în prezent pentru acest patogen. Pentru a permite studiile de biologie a populației asupra agentului de sifilis și pentru supravegherea epidemiologică la scară globală, trebuie introdus un instrument armonizat de tastare. Recent, am publicat o nouă secvență multi-locus (MLST), cu potențialul de a spori semnificativ datele epidemiologice în mai multe aspecte (de exemplu, distingerea cladelor diferite ale sifilisului, subdimensionarea în interiorul acestor clades și, în final, distingând subspecii diferite de non- cultivabile treponme patogene). În acest scurt raport, introducem baza de date PUBMLST pentru stocarea datelor DNA Treponemal și pentru atribuirea profilurilor allelice și a tipurilor de secvențiere. Mai mult, am rezumat date epidemiologice ale tuturor tulpinilor treponemale (n = 358) cu secvențe ADN disponibile în tastând loci și au găsit mai multe asociații între grupele genetice și caracteristicile pacienților. Acest studiu propune înființarea unei singure Mllst de T. p. Palidum și încurajează cercetătorii și comunitățile de sănătate publică să utilizeze această bază de date publicitată ca un instrument universal pentru studiile de tipare moleculară a patogenului sifilisului.

Lasă un răspuns

Adresa ta de email nu va fi publicată. Câmpurile obligatorii sunt marcate cu *