Sequenza a lungo termine ripetuta


Nome e Modifica della coda

Il genoma del lievito Saccharomyces Cerevisiae contiene cinque famiglie retrotraspapspap: Ty1 a Ty5. I LTR di questi 5 elementi sono diversi di dimensioni e sequenze e sono designati da lettere greche.

ty nome e dimensione del ltr
TY1 Δ334PB
TY2 Δ332PB
ty3 σ340pb
τ371pb
TY5 Ω251PB

ComposizioneModifier

Sono tutti suddivisi in tre regioni, indicato in relazione alla loro posizione sul mRNA: U3 (per unica in 3 ‘dell’RNA), r (per ripetuto ad entrambe le estremità dell’RNA) e U5 ( per solo 5 ‘RNA).

Studi condotti sull’effetto delle delezioni del frammento o delle sostituzioni di base della sequenza HIS4-912Δ di Solo-LTR hanno mostrato che i LTRS hanno tutti i segnali necessari per l’avvio e la terminazione della trascrizione mediante RNA Polymerase II (Fulton et al 1988, Hirschman et al., 1988, Dudley et al., 1999). Le sequenze promotori (Tata Box) sono attive solo a livello di LTR in 5 ‘perché richiedono la presenza di regioni normative della trascrizione, situate a valle all’inizio della fase di codifica TYA (Fulton et al. 1988). D’altra parte, i siti di poliadenylation sono attivi solo a livello di LTR in 3 ‘, poiché richiedono la presenza di regioni normative presenti solo nella parte 3’ dell’mrondazione (Hou et al., 1994). La regione R del LTR si trova ad entrambe le estremità della trascrizione ed è essenziale per la trascrizione opposta di questo mRNA di CDNA.

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